1148, nach der Invasion der Almohaden, die einen intoleranten Islam verfolgten, wurde seine Familie vor die Wahl gestellt, entweder zu konvertieren oder auszuwandern. Maimonides Familie floh in die Provence und ließ sich 1160 in Fés nieder. 1165 zog die Familie weiter nach Jerusalem, dann nach Alexandria und schließlich ins heutige Kairo. Dort war er ab 1170 Arzt und ab 1185 Leibarzt des Sekretärs des Sultans.